En un futuro lejano, la humanidad hace mucho que abandonó la tierra y habita el ancho espacio. Shion Uzuki, un miembro de élite de Vector, se ve arrastrado a una lucha por la búsqueda de una misteriosa fuente de energía, debido a un ataque a su nave por parte de los Gnosis. Los Gnosis son una raza alienígena de la que apenas se sabe nada, pocas cosas se conocen de ellos aparte de su forma fantasmagórica.

El viaje de Shion le conducirá al poderoso Zohar, y la llave de la historia perdida de la tierra.