En un futuro distante, la humanidad está dividida en dos poderes: Unión y Deague. Han continuado una larga guerra que nadie está seguro cuando comenzó. La Unión utiliza robots tripulados llamados Strain, mientras que Deague usa Tumors, armas avanzadas sin tripulante.
Sara Werec, una hija de prestigiosa familia, ingresa a la academia de la armada para convertirse en un Reisner (piloto de Strain). Su hermano, Ralph Werec, fue enviado 130 años luz de distancia cuando Sara tenía 11 años y sabiendo que no volvería a verlo núnca más ya que tardaría 400 años.
Al perder a sus padres a muy corta edad, Sara tiene el complejo de idolatrar a su hermano y vive únicamente para reencontrarse con él, por lo que decide combertirse en la mejor Reiner para seguir a su hermano.
Un día, el planeta que Sara vive es atacado repentinamente por Deague repentinamente. Sorprendente es su hermano Ralph quien llega a traer a una niña misteriosa durmiendo en una cápsula
Para buscar la verdad, Sara debe seguirle sus pasos pero es derrotada, destruyendo su Mimic (copia del piloto escencial para la unión del Strain con el Reiner), por lo que tendrá que unirse a las fuerzas de cualquier forma para poder encontrar a su hermano y así aclarar todas sus dudas.